卷首集例先天图说天地人物气候相应说天地人物气候相应图释方历代医学姓氏三代以前，圣君贤相，创为医药，以济死生者也。秦汉以后，有通经博史，修身慎行，闻人巨儒，兼通乎医。医极其明者也。以医为业，世代相承者也
自序凡例（六则）卷一 中风门中风（类中导入）卷二 诸伤门伤寒暑（参绪论暑证）湿（湿热）燥火伤饮食劳倦虚损（传尸）卷三 寒热门发热热潮热恶寒（背恶寒）振寒战栗寒热疟厥卷三 诸气门上气郁痞满腹满水
叶序陈序自序卷一脏腑经络先后病脉证第一卷二痉湿病脉证第二卷三百合狐惑阴阳毒病证治第三卷四疟病脉证并治第四卷四疟疾总论卷五中风历节病脉证治第五卷六血痹虚劳病脉证治第六卷七肺痿肺痈咳嗽上气病脉证治第七卷八
《黄帝内经》简介重广补注黄帝内经素问序《黄帝内经·素问》上古天真论篇第一四气调神大论篇第二生气通天论篇第三金匮真言论篇第四阴阳应象大论篇第五阴阳离合篇第六阴阳别论篇第七灵兰秘典论篇第八六节藏象论篇第九
年序曹序胡序张序姚序目论目议外障外障治法内障内障治法小儿痘毒眼治法小儿疳积眼治法治小儿雀目法附刻薛氏选方
原序附刊丹方补遗序自序凡例贸药辨真假诸症歌诀单方经验丹方汇编中风预防中风风气痛（附痿症、脱颏）虚劳血证肿胀反胃噎膈痰饮咳嗽梦遗白浊伤寒瘟疫（附冒风寒方）疟疾痢疾肠风下血便血淋漓并小便闭塞霍乱吐泻（附痧
秘藏膏丹丸散方剂
仁斋直指方论
序浮（阳）沉（阴）迟（阴）数（阳）滑（阳中阴）涩（阴）虚（阴）实（阳）长（阳）短（阴）洪（阳）微（阴）紧（阳）缓（阴）芤（阳中阴）弦（阳中阴）革（阴）牢（阴中阳）濡（阴）弱（阴）散（阴）细（阴）伏（阴
秘传刘伯温家藏接骨金疮禁方